Biodiversité microscopique | L '«arche microbienne» se prépare à sauver les formes de vie invisibles de la terre

Il y a déjà deux « coffres de Noé » sur la planète. «L'arche de Noé» ou Banque de semences mondialeun bunker qui maintient la plus grande réserve de la diversité des cultures sur la planète à l'intérieur d'une montagne norvégienne, a inspiré une initiative internationale pour préserver la diversité microbienne de la planète avant qu'elle ne disparaisse. Il s'agit de «l'arche microbienne» («microbiote vault»), créée en 2018 et entre maintenant une phase de croissance active surplombant devenir une protection mondiale des micro-organismes bénéfiques fondamentaux pour la santé humaine, animale et environnementale. Objectif clair: Sauvez les formes de vie invisibles de la terre.

Annoncée en coïncidence avec la Journée mondiale du microbiome, le 27 juin, cette proposition a été officialisée dans un article publié dans le magazine «Nature Communications» par une équipe de 25 scientifiques qui délimit, en plus des réalisations réalisées, un cadre éthique pour assurer une gouvernance équitable et la souveraineté des déposants sur leurs échantillons.

« Le« microbiote du coffre-fort »représente un effort proactif pour protéger et préserver la vie microbienne qui est essentielle à la santé de notre planète et de ses habitants»Souligne María Gloria Domínguez-Bello, présidente de l'initiative.

Entrée de la Banque mondiale de Svalbard. / Nordgen

Le microbes – Les bactéries, les virus et les champignons, entre autres formes de vie – sont présents dans tous les environnements naturels et dans le corps humain, où ils constituent des communautés appelées Microbiomes. Ces communautés remplissent des fonctions clés: dans l'être humain, ils aident à digérer les aliments, à renforcer le système immunitaire et à agir comme une barrière contre les organismes pathogènes. Mais son équilibre est actuellement menacé.

Le perte de diversité microbienne Il est lié aux pratiques humaines modernes, telles que l'utilisation excessive d'antibiotiques, les naissances par césarienne et les aliments artificiels chez les bébés. En parallèle, les additifs alimentaires et la pollution de l'environnement affectent la santé du microbiome dans son ensemble.

Menace analogue au changement climatique

« Le microbiome est en grand danger, une menace qui, à bien des égards, est analogue au changement climatique« , prévient Martin Blaser, membre du Conseil du projet.

Les effets ne se limitent pas à l'environnement humain. L'agriculture intensive, l'altération des pesticides et des habitats affectent également les microbiomes du sol, indispensables pour la fertilité et le cycle des nutriments. Le dégel du pergélisol dans l'Arctique, par exemple, menace les micro-organismes capables de réguler les émissions de gaz à effet de serre. « Les microbes maintiennent non seulement la santé de notre corps, mais aussi celle de la planète »dit Blaser.

Le «microbiote de coffre-fort» a été fondé il y a sept ans avec l'idée de créer un Dépôt mondial de micro-organismes sains qui peuvent être utilisés à l'avenir pour restaurer les écosystèmes, améliorer l'agriculture ou développer des thérapies médicales. Au cours de sa phase pilote, déjà achevée, le projet a collecté plus de 2 000 échantillons fécaux et aliments fermentés de différents pays.

Représentation du corps humain et des bactéries qui y prédominent.

Représentation du corps humain et des bactéries qui y prédominent. / Darryl far / nhgri

Les échantillons sont conservés à des températures cryogéniques (−80 ° C) à l'Institut de microbiologie médicale de l'Université de Zurich, en Suisse. Dans la nouvelle étape, appelée «Growth Phase 1», qui se déroulera jusqu'en 2029, Il est prévu d'élargir la collection de 10 000 échantillons et établir un quartier général permanent dans un climat froid. Parmi les options prises en compte figurent la Suisse, le Canada et d'autres pays ayant des conditions adéquates.

Le projet vise à diversifier son financement par le biais de fonds publics, au-delà du soutien actuel des universités et de la philanthropie. Cependant, ses objectifs ne sont pas commerciaux. «Le« microbiote de coffre préserver la diversité microbienne Dans un cadre éthique, sans but lucratif et collaboratif « , expliquez les auteurs de l'article.

Améliorer la santé humaine

L'un des piliers du projet est son Approche éthique. La souveraineté du dépôt est respectée, ce qui signifie que les chercheurs ou les communautés qui fournissent des échantillons maintiennent un contrôle total sur eux. Ils ne peuvent y accéder qu'avec leur autorisation, et dans le cas où les séquences génétiques sont partagées, cela se fera sous des licences d'accès gratuites définies par les déposants eux-mêmes.

« Nous sommes absolument déterminés à développer le » microbiote de coffre-fort « afin de maximiser les capitaux propres dans le monde entier »explique Domínguez-Bello. Les principes directeurs comprennent une collaboration équitable, le respect des connaissances locales et la répartition équitable des avantages.

En plus, Des protocoles standardisés pour la collection, le transport et la conservation des échantillons ont été développés. Alors que les technologies pour reproduire les microbes préservés sont toujours en cours de développement, les scientifiques derrière l'initiative font confiance que, au fil du temps, ils peuvent être utilisés Restaurer les écosystèmes endommagé ou amélioré la santé humaine.

Escherichia coli, l'une des nombreuses espèces de bactéries présentes dans l'intestin humain.

Escherichia coli, l'une des nombreuses espèces de bactéries présentes dans l'intestin humain. / Niaid

« Nous pensons qu'un jour science avancera suffisamment pour avoir de bonnes techniques de restauration. Mais s'il est trop tard et que les membres clés du microbiome disparaissent, nous ne pourrons pas les récupérer, sauf si nous les avons stockés en toute sécurité », explique Blaser.

L'initiative envisage l'utilisation potentielle de ces collections pour développer des traitements médicaux, avancer en biotechnologie, améliorer les cultures ou même contrecarrer les effets du changement climatique. Cependant, leurs moteurs reconnaissent que bon nombre de ces utilisations sont encore spéculatives.

De sa conception, le 'Vault de microbiote«Il a augmenté jusqu'à ce que plus de 100 chercheurs de 32 pays soient impliqués. L'initiative maintient des liens avec des organismes tels que l'ONU, avec lesquels il a favorisé les actions de sensibilisation sur l'importance des microbiomes, y compris les présentations lors de la conférence des parties sur la biodiversité (COP24).