Les scientifiques ont découvert un groupe unique et jamais vu auparavant d’entités virales dans l’intestin et la bouche des humains : ces « viroïdes » en forme d’« obélisque » pourraient influencer l’activité génétique au sein du microbiome humain, suggèrent les spécialistes. Cependant, leur fonction spécifique et leur effet bénéfique ou nocif pour l’organisme restent encore inconnus.
Les recherches menées par les scientifiques Andrew Fire et Iván Zheludev, de l’Université de Stanford, aux États-Unis, ont permis le développement d’un logiciel sophistiqué pour analyser les gènes actifs des microbes qui vivent chez l’homme : l’avancée révélée viroïdes étranges ou organismes ressemblant à des virusqui vivent dans ces microbes ou bactéries et présentent des séquences d’ARN (acide ribonucléique) sous forme de cercles ou de boucles.
L’énigme des « obélisques »
Selon un article publié dans la revue Science, les micro-organismes qui composent le microbiome humain et que l’on retrouve dans notre bouche et nos intestins ne sont pas seuls : des entités jusqu’alors inconnues semblables à des virus, aux formes allongées étranges que les chercheurs appelaient «obélisques», vivent dans les bactéries et les microbes et sont capables de modifier les gènes de ces micro-organismes.
En stockant et en analysant des quantités massives de séquences génétiques de plantes, d’animaux et de microbes grâce aux dernières avancées de la bioinformatique, les scientifiques révèlent des mondes cachés surprenants : certains d’entre eux pourraient même remettre en question la définition même de la vie. S’il y a encore un débat sur la question de savoir si les virus sont « vivants », puisqu’ils ne peuvent pas se répliquer indépendamment sans les cellules d’un autre organisme, que se passerait-il alors de ces viroïdes en forme d’obélisque ? Que sont-ils exactement ? Quelle est votre fonction ?
Ces questions restent sans réponse, selon les scientifiques à l’origine de la nouvelle étude récemment publiée sur BioRxiv. Par exemple, bien qu’ils sachent qu’ils peuvent modifier la génétique du microbiome humainils ne comprennent toujours pas leur fonction spécifique, pourquoi ils possèdent des boucles d’ARN et, surtout, s’ils sont nocifs ou bénéfiques pour la santé humaine.
Influent-ils sur nos gènes ?
Sin embargo, las secuencias genéticas que identifican a estos viroides se han hallado en todo el planeta: los investigadores creen que al afectar los genes de los microbios y las bacterias que conviven con el ser humano, podrían al mismo tiempo tener algún tipo de influencia sobre Les propres gènes humains.
Les viroïdes ont suscité l’intérêt des chercheurs car ils interagissent avec le génome des plantes, provoquant parfois de graves dégâts. Et bien que l’on ait longtemps pensé que les viroïdes étaient limités aux plantes, des preuves récentes indiquent la présence de génomes à ARN circulaire de type viroïde dans les bases de données de séquences génétiques d’animaux, de bactéries et d’autres formes de vie. Cependant, les « obélisques » semblent être plus étrange et plus complexe que les autres viroïdes.
Les recherches des spécialistes ont révélé près de 30 000 cercles ou boucles d’ARN, chacun comprenant environ 1 000 bases et représentant probablement un « obélisque » différent. Dans de nouvelles études, les scientifiques tenteront de déterminer à quel point les obélisques sont différents de viroïdes connus et d’autres entités de type viroïde.
Référence
Coloniens de type viroïde des microbiomes humains. Andrew Fire, Ivan N. Zheludev et al. BioRxiv (2024). DOOI : https://doi.org/10.1101/2024.01.20.576352
